Nature:全新致癌机制,相分离驱动异常染色质羧酸,促进癌症发展
2021-10-19 02:53 来源:济源妇科医院
白血病的其发展与类似物蛋白质质内在无序地区(IDR)的遗传物质诱发密切方面。各种蛋白质质(还包括mRNA因子、细胞器调节剂和RNA为基础蛋白质)当中的IDR通过液-液二者之间(LLPS)过渡到无所不在器物,制约从细胞器过渡到和焦虑耐受到遗传物质mRNA的无数生器物全过程。
所谓的液-液二者之间(LLPS)是同义揉合两个不方面遗传物质基因型的全过程。该全过程愈演愈烈在细胞核内,并能够过渡到很强各种器物理特适度的域,这些域可以促成白血病,例如急适度白血病的愈演愈烈其发展。在急适度白血病当中,大分子蛋白质(NUP98或NUP214)的反复染色本体易位产生了一种诱发揉合本体,它平常保留大分子蛋白质 IDR——乙酰和乙酰残基(FG)的相联密集段落基因序列。然而,IDR如何导致遗传物质缺失抑制和愈演愈烈唯不吻合。
2021年6年底23日,北弗吉尼亚的大学杜伦分校 Gang Greg Wang 小组等 Nature 发表了题为:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的深入研究期刊。
该深入研究证明了二者之间是白血病过渡到的飞轮因素,白血病通过二者之间获得基因型以设立诱发mRNA因子无所不在器物,这同时加强了它们的遗传物质组类似物适度并在转化全过程当中诱发诱发三维空间细胞器结构的过渡到。该深入研究是早期将二者之间与白血病过渡到联系起来的深入研究之一。因为在其他恶适度当中观察到了类似的遗传物质揉合,文章当中概述的前提也可以解释其他多种类型的白血病。
NUP98–HOXA9还包括两个蛋白质质基序和一个为基础基因序列。为了深入研究NUP98-IDR在白血病愈演愈烈当中的起到,深入研究小组主要使用敲除了为基础基因序列的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。
他们发掘出,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种使用摧毁相-二者之间无所不在本体的化学器物质)处理敏感。浓缩的NUP98-IDR(N-IDR)蛋白质在本体外过渡到液本体无所不在器物。
为了大幅度评估FG段落基因序列对无所不在器物过渡到的酸度依赖于适度和多价适度的特殊适度,深入研究小组制备了带有不同数量FG段落基因序列的分拆N-IDR蛋白质质。他们发掘出N-IDR还包括38个或36个FG以酸度依赖于适度的方式段落过渡到的液滴,那些还包括27个或11个FG的却不能进行二者之间。断定NUP98–HOXA9当中的IDR以价依赖于和酸度依赖于的方式设立LLPS。
NUP98–HOXA9通过同源复合物与DNA为基础,导致白血病愈演愈烈全过程当中的遗传物质生理。整整,深入研究小组通过细胞器免疫沉淀和高通量测序来评估IDR抑制的二者之间对NUP98–HOXA9细胞器类似物适度的制约。
%-, N-IDRWT/A9很强显着加强的遗传物质组销售额,而与无监督聚类定义的岩值亚类或多或少。此外,长而人口稠密的超强加强子样岩是N-IDRWT/A9所十分相似的,并且在发育期和白血病方面遗传物质富含。
为了大幅度评估IDR诱发的LLPS在嵌合本体细胞器类似物当中的起到,他们利用了生态学和药理学的方式,证明了IDR抑制的LLPS在加强嵌合mRNA因子类似物适度方面的因果起到,特别是在超强加强子样岩处看到的那些。断定IDR加强揉合本体的遗传物质组为基础并且加强靶遗传物质抑制。
为了测试者NUP98–HOXA9通过LLPS过渡到细胞器循环系统的潜能,深入研究小组作用于了表达N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞的Hi-C图谱,揭示了DNA循环系统和遗传物质彼此之间的高度方面适度。
为了确认N-IDRWT/A9对Hi-C带入kHz的制约,他们汇聚了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9表达细胞当中500个最强烈的N-IDRWT/A9占据启动子彼此之间的相互起到计数。%-,N-IDRWT/A9循环系统以基本上与CTCF或多或少的方式过渡到,与二者之间飞轮前提原则上。另外,N-IDRWT/A9特异适度循环系统继续连通加强子和靶遗传物质彼此之间的连通,背书了揉合mRNA因子的IDR通过二者之间在超强加强子样靶点和癌遗传物质彼此之间诱发DNA循环系统的观点。
综上所述,该深入研究发掘出NUP98–HOXA9当中带有的LLPS活适度IDR对白血病的愈演愈烈和诱发遗传物质表达程序来的抑制至关重要。这些效应由IDR的潜能抑制:1)加强mRNA因子与遗传物质组靶点的为基础;2)促成加强子和癌遗传物质内含子彼此之间的低速循环系统。
该深入研究透过了一个诱发基因型的基本原理适度证据,该基因型在转化全过程当中促成LLPS飞轮的mRNA因子为基础和3D细胞器分拆。由于含IDR的LLPS活适度分子与国际上的白血病有关,该深入研究概述的前提也可以解释其他多种类型的白血病。
原始说是:
Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.
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